พวกตำรวจสืบคดีจากข้อความของโทรศัพท์ ซึ่งโคนันตั้งข้อสังเกตว่าผู้ต้องสงสัยมีทั้งหมด 4 คนตามจำนวนข้อความที่บันทึกเอาไว้ ทว่าเสียงข้อความสุดท้ายก็คือเสียงของครูโคบายาชินั่นเอง! คนร้ายของคดีนี้คือใครกันแน่? และมันเกี่ยวข้องกับโรคแพ้เกสรดอกไม้ยังไงกันนะ?