พวกโคนันพยายามไขปริศนาว่าใครเป็นคนฆ่าเซคิงุจิ แต่จู่ ๆ ก็เกิดคดีฆาตกรรมซ้อนขึ้นมา เจ้าของบ้านซึ่งอยู่ในชั้นสามตามลำพังถูกใครบางคนฆ่าตาย พวกโคนันลงความเห็นว่าคนร้ายน่าจะยังแอบซ่อนอยู่ การค้นหาจึงเริ่มขึ้น