โคนันได้รับคำสั่งให้ดูแลเด็กที่เรียกตัวเองว่า คุณซานต้า เพราะแม่ของเด็กกำลังโดนคนปองร้ายสุดท้ายเธอก็ถูกจับตัวไป โคนันเจอขนนกตกอยู่ในบ้านที่ถูกรื้อค้น จึงตามสืบจนรู้ว่าคนร้ายเป็นคนที่คอยจับนกที่ใกล้สูญพันธุ์มาขาย คนร้ายเข้าใจผิดว่าแม่เด็กรู้เรื่องนี้จึงคิดจะจัดการ แต่พอเข้าใจกันและคิดจะมอบตัว เพื่อนของคนร้ายก็เข้ามาหมายจะแย่งนกไปขาย โดยจับเด็กเป็นตัวประกันและเป็นโคนันที่ช่วยไว้ได้