โคโกโร่และชินอิจิได้รับเชิญไปปาร์ตี้ในเรือผีสิง ท้ายที่สุดก็เกิดการฆาตกรรมขึ้นบนเรือ ทั้งหมดจึงต้องหาตัวคนร้ายและคนที่ออกโรงไขปริศนาก็เป็นชินอิจิ นักสืบม.ปลายที่ลือว่าตายไปแล้ว อีกด้านไฮบาระก็ตกอยู่ในมือของโจดี้ โดยมีเบลม็อดในคราบของคุณหมออาราอิเดะตามมาจนพบตัวในที่สุด และนั่นทำให้ต่างฝ่ายต่างปะทะกันอย่างดุเดือด