พวกโคนันตามรอยพวกไฮบาระกับมิทสึฮิโกะไปจนกระทั่งเจอรหัสลับที่ทั้งสองคนทิ้งไว้ คนร้ายก่อเหตุครั้งนี้เพราะไม่อาจทนเห็นความโหดร้ายที่มนุษย์หยิบยื่นให้กับสัตว์ เขาต้องการช่วยจูเบกับลูกของมันไว้โดยแยมและกับชีวิตมนุษย์เช่นกัน