ในห้องสมุด ระหว่างที่คุณครูโคบายาชิกำลังเก็บหนังสือกลับพบกับกระเป๋าเงินภายในมีข้อความเขียนไว้ว่า “ขอบใจนะ ป.1 ห้อง เอ โมริ รัน” เป็นเรื่องราวเมื่อ 10 ปีที่แล้ว ที่รันและชินอิจิแอบเข้ามาภายในโรงเรียนตอนกลางคืนและพบบุคคลปริศนาในห้องสมุด !!