คุโด้ ชินอิจิเป็นยอดนักสืบม.ปลาย เขาถูกกรอกยาพิษโดยชายชุดดำจึงกลายเป็นเด็กประถม เพื่อสืบหาเบาะแสและยาแก้พิษเขาจึงเข้าไปอยู่ที่สำนักงานนักสืบโมริ โคโกโร่ พ่อของเพื่อนสาวคนสนิท