จู่ ๆ ชายที่กำลังถูกตำรวจไล่ตามก็วิ่งมาชนพวกโคนันและทำสมุดตกโดยไม่รู้ตัว พวกโคนันเก็บสมุดนั้นได้และเมื่อเปิดดูก็พบข้อความที่เป็นรหัสลับ โคนันคาดว่าน่าจะเป็นการนัดพบเจอเพื่อแลกซื้อยาเสพติดแต่เขาไม่อยากบอกเพื่อน ๆ ให้รู้จึงถ่ายรูปเก็บไว้ก่อนส่งให้ตำรวจ จากนั้นเขาก็ตามสืบต่อและมีปริศนาที่ไขไม่ออก เมื่อโคนันไขปริศนาไม่ออกเขาก็เชื่อมือคู่แข่งคนสำคัญอย่างฮัตโตริ เฮย์จิที่จะมาช่วยทำให้ปริศนาครั้งนี้กระจ่าง