โคโกโร่ถูกเรียกตัวไปช่วยทำคดีฆาตกรรมอย่างกระทันหัน เมื่อสืบไปสืบมาก็รู้ว่าเป็นลูกศิษย์ของนักเขียนหนังสือนินจา หลังจากรวบรวมหลักฐานเพื่อหักล้างเรื่องเวลาและข้อความในโทรศัพท์แล้ว...คนร้ายคราวนี้ก็คือ !?