จากคดีโจรปล้นที่ทำการไปรษณีย์ซึ่งเกี่ยวเนื่องกับความแค้นที่มีต่อกรมตำรวจทำให้เจ้าหน้าที่ตำรวจผู้ที่เคยร่วมงานกับหมวดซาโต้เสียชีวิตและคราวนี้หมวดชิราโทริเป็นฝ่ายโชคร้ายโดนระเบิด พร้อมกันนี้คนร้ายยังส่งข้อความท้าทายกรมตำรวจด้วยการข่มขู่ว่าจะกดระเบิดลูกแรกในจุดที่วางไว้ โคนันกับกลุ่มหมวดซาโต้ช่วยกันตามหาระเบิดจนพบแต่กลับเป็นระเบิดปลอม จนกระทั่งระเบิดของจริงทำงานความโกลาหลก็เกิดขึ้น ระหว่างนั้นมีเด็กติดอยู่ในลิฟต์ทำให้โคนันกับหมวดทาคางิต้องเข้าไปช่วยโดยในเวลานั้นทั้งคู่เพิ่งรู้ว่ามีระเบิดอีกลูกซ่อนอยู่และกำลังนับถอยหลังรอเวลาทำลายทุกสิ่งทุกอย่างให้ราบคาบ