โคนัน กับ โคโกโร่ ต้องไขปริศนาที่ซับซ้อนซ่อนเงื่อนตามที่ผู้ว่าจ้างบอก ก่อนเวลา 4 ทุ่ม ไม่เพียงแต่โคนันเท่านั้นแต่เป็นนักสืบคนดังทุกคนก็โดนเชิญมาด้วย หากทำไม่สำเร็จ รัน กับเหล่าเด็กๆ ต้องถูกระเบิดตาย