ปริศนาสุดระทึกกลางทะเล โมริ โคโกโร่ รัน โคนัน และขบวนการนักสืบได้ไปทริปล่องเรือของกองกำลังป้องกันตนเอง ขณะที่ทุกคนกำลังเพลิดเพลินกับวิวท้องทะเล ก็ได้เกิดเสียงดังลั่น พร้อมกับพบศพเจ้าหน้าที่นอนเสียชีวิต