สถาบันวิจัยสิ่งมีชีวิตขนาดยักษ์ โมนาร์ก จำเป็นต้องขอความช่วยเหลือจากก็อตซิลล่า เพื่อมาปกป้องเหล่ามอนสเตอร์ยักษ์อย่าง มอธรา,โรแดน และ ศัตรูคู่อาฆาตอย่าง คิงไคโดรา มังกรสามหัว